Dans le style typique de Škoda, le coffre du Kodiaq offre des caractéristiques extrêmement pratiques. Les objets peuvent être fixés dans le coffre à l'aide de fixations de chargement. Il suffit de glisser vos cartons ou vos sacs de courses, par exemple, entre les fixations pour qu'ils ne glissent plus. Les fixations peuvent être repliées et rangées sur le côté du coffre ou sous le plancher variable du coffre.

D'un côté, une surface pratique et facilement lavable, de l'autre, une élégante moquette textile. Il suffit de retourner le tapis pour obtenir une surface adaptée à la charge.

Grâce à l'ingénieux système de filets, de crochets et d'étagères dans le coffre, il n'est pas nécessaire de faire des compromis entre agilité et praticité. Les filets de coffre avec crochets de fixation empêchent les petits objets de se déplacer.

La grande variabilité et l'utilisation du coffre du Kodiaq bénéficient également de deux crochets robustes sur les côtés. Ils sont conçus pour accrocher des objets ou des bagages qui, autrement, seraient instables ou ne tiendraient pas sur le plancher du coffre.